Вони присутні в обох іграх, але одна команда буде активнішою за іншу залежно від титулу. Ви частіше стикатиметеся з Team Magma, граючи в Pokemon Omega Ruby, або Team Aqua, граючи в Pokemon Alpha Sapphire.

Team Aqua Hideout знаходиться в невеликій бухті в затоці Lilycove City. Для входу на базу вам знадобиться Surf. Кілька зелених деформаційних подушечок розташовано навколо схованки. Наступайте на них, щоб телепортуватися в нову область.

Локації у світі Pokémon Team Magma Hideout (яп. マグマ団アジト Team Magma Hideout), що називається Magma Hideout в іграх Generation III, є Операційна база команди Magma в регіоні Hoenn, розташована на невеликій острівній печері на околиці Ліліков-Сіті.

Мета Team Aqua полягає в тому, щоб пробудити Kyogre, легендарного Ocean Pokémon, тож вони можуть використовувати його сили для розширення моря, оскільки, на їхню думку, це принесе користь як людям, так і покемонам. Вони є запеклими суперниками з Team Magma, тому що у них протилежні цілі.

Після того як йти до mt. вогнище, перейти до Lavaridge town і йдіть до Jagged Pass. Там ви зможете піти до схованки магми. Потім ідіть до Слейтпорту, потім ідіть до Лілікову перемогти команду аква.