Лінійне картування епітопів — це наш бюджетний вибір, використовується, коли є підозра, що епітоп є принаймні частково лінійним, наприклад, коли антиген сам по собі був пептидом. Лінійні епітопи визначаються амінокислотами в певній ділянці білка, які знаходяться поруч у послідовності та структурі.

Аналіз сайтів зв’язування — відображення епітопів. Картування епітопів зазвичай виконується з метою структурного аналізу або для ідентифікації та характеристики властивостей зв'язування антитіл.

Лінійні епітопи складаються з безперервних залишків білкової послідовності. Конформаційні епітопи складаються із залишків, які є розривними в білковій послідовності, але знаходяться в безпосередній близькості, щоб утворити антигенну поверхню на тривимірній структурі білка.

У той час як безперервний (також званий послідовним або лінійним) епітоп є послідовним фрагментом білкової послідовності, розривний (також званий конформаційним) епітоп складається з кількох фрагментів, розкиданих уздовж білкової послідовності та зведених разом у просторовій близькості, коли білок згортається ( Фургон …

В-клітинні епітопи класифікуються як лінійні або конформаційні. Лінійні епітопи є фрагменти безперервних амінокислот у білковій послідовності. Конформаційні епітопи складаються із амінокислотних залишків, які можуть бути розділені в первинній послідовності білка, але наведені у фізичну близькість через згортання білка.

Епітоп є частина антигену, яку розпізнає імунна система господаря, викликаючи імунну відповідь на вторгнення патогену.