Реактом є безкоштовна база даних шляхів із відкритим вихідним кодом, підібрана експертами. Наша мета — надати інтуїтивно зрозумілі інструменти біоінформатики для візуалізації, інтерпретації та аналізу знань про шляхи для підтримки фундаментальних досліджень, аналізу генома, моделювання, системної біології та освіти.
Reactome: база даних реакцій, шляхів і біологічних процесів. Зміст. опис. Reactome: база даних реакцій, шляхів і біологічних процесів.
Крім того, KEGG має дещо штучне розрізнення між метаболічними шляхами та шляхами білок-білкової взаємодії; у Reactome ви можете використовувати ідентифікатори GO, щоб розрізняти типи реакцій, не розділяючи реактом штучно.
Reactome є надзвичайно корисною відправною точкою для:
- Зрозумійте вичерпні молекулярні деталі шляху на основі доступної літератури.
- Знати, як різні білки та малі молекули взаємодіють in vivo для досягнення біологічних функцій.
- Вивчіть перехресні перешкоди (спільні білки та реакції) між різними шляхами.
Reactome широко використовує білкові комплекси у представленнях шляхів, описуючи їх утворення, дисоціацію та діяльність. Навпаки, терміни GO зазвичай застосовуються до діяльності окремих генних продуктів. Reactome створює нову сутність для кожної комбінації фізичної сутності та місцезнаходження.
Проект Reactome, заснований у 2003 році, очолює Lincoln Stein з OICR, Peter D'Eustachio з NYU Langone Health, Henning Hermjakob з EMBL-EBI та Guanming Wu з OHSU.