Що таке сімейство Alu repeat?

Alu

Alu

Це РНК продукти транскрипції специфічних для приматів змінних елементів, які називаються елементами Alu. Цих елементів надзвичайно багато, вони складають понад 10% геному людини та від 100 до 1000 цитоплазматичних копій Alu РНК на клітину.

повтори

повтори

Повторювані послідовності (також відомі як повторювані елементи, повторювані одиниці або повтори) є короткі або довгі шаблони, які зустрічаються в кількох копіях по всьому геному.

https://en.wikipedia.org › wiki › Repeated_sequence_(ДНК)

є сімейство коротких вкраплених елементів (SINE), які реплікуються через LINE-опосередковану зворотну транскрипцію транскрипту РНК-полімерази III (Rogers 1983; Mathias та ін. 1991; Dewannieux та ін. 2003). Кожен елемент Alu має довжину приблизно 280 bp, за яким слідує хвіст poly-A змінної довжини.

Алюмінієві елементи є дуже повторювані послідовності ДНК, які можна класифікувати як SINE (короткі перемежовані елементи), які самі є типом «неавтономного» ретротранспозону. (Ретротранспозони — це ТЕ, які пересуваються по геному через РНК-посередника.)

Алу належать до Сімейство SINE (Short Interspersed Nuclear Elements) повторюваних елементів; вони з’явилися 55 мільйонів років тому з випромінюванням приматів шляхом злиття 5′ і 3′ кінців гена 7SL РНК, який кодує фрагмент РНК частинки розпізнавання сигналу (SRP).

Є також експериментальні докази того, що повтори Alu причетні до процес ініціації трансляції в клітинах людини (Hasler and Strub, 2006b), і вони також можуть бути альтернативним джерелом для сплайсингу, якщо вони присутні в інтронних областях людських генів (Hasler and Strub, 2006a).

Члени родини Alu — це короткі (приблизно 311 пар основ) вкраплені елементи ДНК. Поліморфізм tPA демонструє три різні генотипи: Alu+/+ та Alu-/- гомозиготи та Alu+/- гетерозиготи, які базуються або на вставці (I), або на видаленні (D) елемента Alu.

Алюмінієві елементи є відповідає за регуляцію тканиноспецифічних генів. Вони також беруть участь у транскрипції сусідніх генів і іноді можуть змінювати спосіб експресії гена. Alu елементи є ретротранспозонами і виглядають як копії ДНК, зроблені з РНК, кодованих РНК-полімеразою III.