Лі та його люди заарештували Брауна та перевезли його до будівлі суду в сусідньому Чарльз-Тауні, де він був ув'язнений, поки його не могли судити. У листопаді суд присяжних визнав Брауна винним у державній зраді Співдружності Вірджинії. Браун був повішений 2 грудня 1859 року у віці 59 років.27 жовтня 2009 р
Суд над Джоном Брауном, якого звинуватили у вбивстві, повстанській змові з поневоленими людьми та зраді штату Вірджинія, розпочався 27 жовтня і тривав лише п’ять днів. Присяжним знадобилося лише 45 хвилин, щоб прийняти рішення — винним за всіма обвинуваченнями. 2 листопада Брауна засудили до повішення на шибениці.
Джон Браун — це біографія, написана В. Е. Б. Дю Буа про аболіціоніста Джона Брауна. Опубліковано в 1909 році, він розповідає історію Джона Брауна, від його християнського сільського виховання до його невдалих бізнес-починків і, нарешті, його «кровної помсти» з інститутом рабства в цілому.
Джон Браун присвятив своє життя скасування рабства; для нього будь-які засоби, використані для досягнення цієї мети, були виправданими. Він був готовий убити або бути вбитим у цій спробі, рішучому розриві з ненасильницьким опором, який підтримувала більшість аболіціоністів того часу.
Рейд Harpers Ferry був його найвідомішим актом. Браун утримував Харперс-Феррі з пізнього вечора неділі, 16 жовтня, доки його не схопили 18-го. Він мав майже необмежену кількість пороху та зброї. Він захопив видатних громадян, найвідоміший полковник Вашингтон.
На закінчення, Джон Браун був героєм. Його вірування, практики та дії змінили історію нації. Він задав темп звільненню від рабства, раба і рабства. Саме завдяки його походам сіверяни були просвітлені, щоб покінчити з рабством.