Ident” означає відсоток ідентичності, тобто відсоток однакових нуклеотидів між двома послідовностями. 100% означає, що в кожній позиції вирівнювання нуклеотид досліджуваної послідовності ідентичний еталонній послідовності.

ідентичність. Ступінь, до якого дві (нуклеотидні або амінокислотні) послідовності мають однакові залишки в однакових положеннях у вирівнюванні, часто виражається у відсотках.

Хоча ідентичність вимірює точні збіги, подібність також враховує заміни на основі ймовірності. Попередження: будьте обережні, інтерпретуючи оцінки ідентичності BLAST. Це пояснюється тим, що BLAST повідомляє % ідентичності для конкретних частин вирівнювання, як правило, не для всього запиту чи послідовності звернень.

«Обкладинка запиту» описує, яка частка «збігу» відповідає вашому запиту. «Відсоток ідентичності» описує частку вирівнювання, яке є ідентичним між двома послідовностями.

Відсоток ідентичності відноситься до кількісне вимірювання подібності між двома послідовностями (ДНК, амінокислотами чи іншими). Очікується, що близькоспоріднені види матимуть вищий відсоток ідентичності для даної послідовності, ніж більш віддалені види, і, отже, відсоток ідентичності певною мірою відображає спорідненість.

Ідентичність BLAST визначається як кількість відповідних основ над кількістю стовпців вирівнювання. У цьому прикладі 50 стовпців, тому ідентичність становить 43/50=86%. У файлі SAM кількість стовпців можна обчислити шляхом підсумовування довжин операторів M/I/D CIGAR.