Який принцип роботи маркерів AFLP?

Ампліфікований поліморфізм довжини фрагмента (AFLP) — це відмінності в довжині рестрикційних фрагментів, спричинені SNP або INDEL, які створюють або скасовують сайти розпізнавання ендонуклеазами рестрикції. Техніка AFLP заснована на селективна ПЛР-ампліфікація рестрикційних фрагментів із загального гідролізу геномної ДНК.8 листопада 2017 р

Поліморфізм довжини ампліфікованих фрагментів (AFLP) — це метод на основі ПЛР, який використовує селективну ампліфікацію підмножини перетравлених фрагментів ДНК для створення та порівняння унікальних відбитків пальців для цікавих геномів.

Метод поліморфізму довжини рестрикційних фрагментів (ПДРФ) заснований на тому, що певні сайти рестрикційного розщеплення в геномній ДНК втрачаються через мовчазні зміни основи в послідовності розщеплення.

Ця техніка включає п’ять основних кроків, як описано в наступних розділах.

  1. Крок 1: Підготовка шаблону AFLP. Малюнок 1. …
  2. Крок 2: Реакція лігування з рестрикційними фрагментами та адаптерами. …
  3. Крок 3: Селективна ПЛР-ампліфікація. …
  4. Крок 4: Електрофоретичне розділення ампліфікованих фрагментів ДНК. …
  5. Крок 5: Аналіз.

Генетичні маркери можна визначити як специфічні послідовності ДНК з відомим розташуванням на хромосомі і є основними інструментами для вивчення зв’язків і асоціацій. Ці дослідження просто неможливі без можливості диференціювати походження рекомбінантних хромосом на ДНК, отриманих у результаті картографічного схрещування.

Ампліфікований поліморфізм довжини фрагмента (AFLP) — це відмінності в довжині рестрикційних фрагментів, спричинені SNP або INDEL, які створюють або скасовують сайти розпізнавання ендонуклеазами рестрикції. Техніка AFLP заснована на селективна ПЛР-ампліфікація рестрикційних фрагментів із загального гідролізу геномної ДНК.