Зоофлагелляти — це твариноподібні протисти, які викликають у людей такі захворювання, як африканська сонна хвороба та лямблії. Однак деякі зоофлагелляти не є паразитичними і акутальними допомагають переробляти поживні речовини в екосистемі та сприяють здійсненню харчового ланцюга.

Найпростіші (прото або «перші», zoa «тварини») класифікуються відповідно до того, як вони рухаються: зоофлагелляти—рухаються джгутиками. саркодини — пересуваються відростками цитоплазми. інфузорії—рухаються війками.

Джгутики є зазвичай використовується для руху. Вони також можуть бути використані для створення течії, яка приносить їжу. У більшості таких організмів один або кілька джгутиків розташовані на передній частині клітини або поблизу неї (наприклад, евглена). Часто один спрямований вперед, а другий — позаду.

Трипаносоми – це джгутикові найпростіші, які мають пробковий гвинт. Вони заражають різноманітних господарів і викликають такі захворювання, як сонна хвороба і хвороба Шагаса.

Зоофлагелляти засвоюють органічний матеріал шляхом осмотрофія (поглинання через плазматичну мембрану) або фаготрофія (поглинання здобичі в харчових вакуолях).