Який шлях дезамідування аспарагіну?

Дезамідування аспарагіну може відбуватися через три шляхи деградації: (1) нуклеофільна атака альфа-NH-групи на карбонільний вуглець бічного ланцюга, що призводить до п’ятичленного проміжного сукциніміду (циклічного іміду), який гідролізується в суміш аспартату та ізоаспартату; (2) нуклеофільна атака …

Дезамідування аспарагіну включає введення аспарагінової або ізоаспарагінової кислоти, несе чистий аніонний заряд до антитіла через утворення сукцинімідних проміжних продуктів [57]. Гідрофільність проміжного сукциніміду менша в порівнянні як з аспарагіном, так і з аспарагіновою кислотою.

Молекулярний механізм дезамідування Asn добре вивчений (рис. 1). На цьому шляху деградації, карбонільна група бічного ланцюга Asn атакується депротонованою основною NH-групою сусіднього С-кінцевого залишку з утворенням циклічного сукцинімідного проміжного продукту.

Повідомлялося, що дезамідування Asn відбувається за нейтрального pH головним чином за допомогою сукцинімідного механізму, який включає проміжну кільцеву структуру на карбоксильній стороні дезамідуючого залишку (18–20).

Аспарагінсинтетаза (АС) асимілює групу глутамінаміду або амоній в аспартат, утворюючи аспарагін.. Трансамінація глутамату оксалоацетатом за допомогою аспартатамінотрансферази (AspAT) призводить до утворення аспартату, який служить субстратом для синтезу аспарагіну.

Дезамідування є однією з найпоширеніших реакцій деградації білків. У водному розчині, амідний зв'язок у бічному ланцюзі залишків аспарагіну та глутаміну гідролізується з утворенням вільної групи карбонової кислоти. Зокрема, аспарагін схильний до дезамідування.