Який вихід CD hit?

CD-HIT-EST Вхідними даними є набір даних ДНК/РНК формат fasta

формат fasta

FASTA є пакет програмного забезпечення для вирівнювання послідовностей ДНК і білка вперше описаний Девідом Дж. Ліпманом і Вільямом Р. Пірсоном у 1985 році. Його спадщиною є формат FASTA, який зараз є повсюдним у біоінформатиці.

https://en.wikipedia.org › wiki › FASTA

і вихід два файли: швидкий файл типових послідовностей і текстовий файл списку кластерів. Оскільки еукаріотичні гени зазвичай мають довгі інтрони, які викликають довгі прогалини, важко зробити повнорозмірне вирівнювання цих генів.

Вихід CD-HIT CD-HIT друкує 2 файли: вихід і вихід. clstr . вивід містить остаточні кластеризовані ненадлишкові послідовності у форматі fasta, поки вивід. clstr містить інформацію про кластери з пов’язаними з ними послідовностями.

Відображає назву поточного каталогу або змінює поточний каталог. Якщо використовується лише з буквою диска (наприклад, cd C:), cd відображає імена поточного каталогу на вказаному диску. Якщо використовується без параметрів, cd відображає поточний диск і каталог.

Резюме: CD-HIT є широко використовуваною програмою для кластеризація біологічних послідовностей для зменшення надмірності послідовностей і покращення продуктивності інших аналізів послідовностей.

Програвач компакт-дисків є цифровим джерелом. Коли написано 2 вольта на виході, це означає, що коли цифровий сигнал становить 0 дБФС (максимально можливий рівень), вихідна напруга буде 2 В RMS. Більшість програвачів компакт-дисків повинні мати цифровий вихід, що дозволяє використовувати зовнішній ЦАП, який забезпечує бажану вихідну напругу.

CD-ROM призначений лише для читання (ви не можете змінити те, що міститься на диску… роблячи його винятковим пристрій введення). Практично всі комп'ютери можуть читати цей тип диска. DVD-ROM — це те ж саме, що і CD-ROM, але з набагато більшою ємністю, тому ви можете переглядати фільми в цьому форматі.